Comment déchiffrer, à grande échelle, la fonction des milliers de protéines que synthétise une cellule, alors même que nombre de ces protéines ne sont pas clairement identifiées ? Comment mettre en évidence les interactions qu'elles sont susceptibles d'établir avec telle ou telle molécule ? Une équipe de l'université de Yale vient d'accomplir un grand pas technique dans cette recherche d'exhaustivité : elle a conçu la première puce à protéines regroupant la quasi-totalité des protéines de levure (soit 5 800). La principale originalité de son travail a consisté à d'abord cloner tous les gènes de levure et à coupler chacun d'eux avec un gène codant une protéine « marqueur ». Les protéines de fusion correspondantes ont ensuite été individuellement produites dans d'autres levures, purifiées en mettant à profit le marqueur, puis fixées en milliers de spots sur une lame de microscope. Pour révéler les capacités d'interaction d'une molécule donnée avec ces protéines, la lame est mise en contact avec ladite molécule préalablement rendue fluorescente : l'observation de spots de fluorescence révèle alors la présence d'interactions. Dans cette première étude, le système s'est révélé efficace et fiable pour les deux types de molécules (une protéine et des lipides) testés.
La Recherche : http://www.larecherche.fr/data/347/03470093.html
