La connaissance complète des interactions entre les protéines cellulaires semble aujourd'hui à la portée de la science. En effet, des chercheurs américains ont développé une technique capable de répertorier les milliers de contacts physiques entre les protéines d'une même cellule. Ces travaux, publiés dans le numéro de Nature du 10 février, devraient permettre de mieux connaître les différentes voies métaboliques et donc de définir le rôle de chaque protéine dans une cellule. Ces recherches ont été réalisées chez la levure de boulanger Saccharomyces cerevisiae. La levure est un organisme unicellulaire qui présente de nombreuses similarités avec les cellules d'organismes plus évolués telles que les cellules humaines. Elle constitue donc un excellent modèle pour l'étude des processus biologiques mis en jeu à l'échelle de la cellule. Très étudiée en laboratoire, son génome a été totalement séquencé en 1996. Ainsi, environ 6000 gènes ont pu être identifiés. Les équipes de S.Fields (Université du Washington, Seattle, USA) et J.Rothberg (CuraGen Corporation, New Haven, USA) ont analysé les interactions globales entre les protéines de levure. Deux méthodes, qui nécessitent la connaissance de la totalité du génome, ont été utilisées. Chacune d'elles fait appel à la biologie moléculaire et à la bio-informatique. En effet, l'analyse des interactions protéine/protéine aurait été particulièrement lente et fastidieuse sans le développement d'un système automatisé. Grâce à cette technologie, 957 interactions impliquant 1004 protéines différentes ont été détectées. Les chercheurs espèrent, à terme, créer une cartographie des interactions entre toutes les protéines de levure. Cette technique devrait être applicable aux cellules humaines et, lorsque l'intégralité du génome humain aura été séquencée (dans 1 à 2 ans), devrait permettre de définir la fonction des 60 à 100000 gènes que compte une cellule humaine. Au delà de la connaissance fondamentale intime des interactions gènes-protéïnes, l'enjeu médical et industriel de ces recherches est immense car elles déboucheront sur la mise au point d'une nouvelle génération de molécules qui devraient s'avérer très efficaces contre de nombreuses maladies, maladies auto-immunes, cancer et maladies neurologiques notamment.
http://www.nature.com/server-java/Propub/nature/403623A0.frameset?context=toc
BBC News : http://news.bbc.co.uk/hi/english/sci/tech/newsid_639000/639195.stm
Nature : http://www.nature.com/server-java/Propub/nature/403623A0.frameset?context=toc
